整顿完集团的事情后，藤原开始着手处理组织事情。
经由贝尔摩德提醒，他为了不造成大的动荡，将组织的研究基地分批次销毁。
研究人员以及相关工作人员进行了一顿整顿，该处理的处理，该放走的放走，该留下的换了个身份入职海星科技继续做相关的研究。
期间小五郎带着柯南、小兰和园子来到了京都据说是八年前位于京都山能寺中的一尊国宝级佛像遭到偷窃。
寺院的住持委托他们解读一幅可以判断佛像藏匿地点的谜样的画像，因而请来了小五郎帮忙。
小五郎向住持保证自己会尽力后便带着小兰和柯南准备拜访一下自己的大弟子。
不曾想对方先一步主动找了过来，并得知他们这次来的缘由后随即表示这事简单，因为他之前也一直在想这个事情。
于是为了让众人少走弯路，藤原直接在地图上标了个地点告诉小五郎佛像大概率就在这里。
柯南和服部有一大堆问题想要问，不过藤原并没有给机会，以自己很忙为由与众人告别。
原本他并不是很想掺和这件事情的，但是一想到原著里还处于懵懂状态的服部已经告白了，自然不会挂念他的初恋，也不会联想到破案的关键，因为必要站出来透个底让他们别忙活。
与藤原星海分别的众人虽然感到一丝疑惑不过小五郎和众人还是决定前去查看时还真发现了佛像。
服部看到佛像空缺的眼睛，忽然意识到自己多年前捡到的东西并非是信物而是佛像的眼珠，也算是了却了心里的遗憾。
成功找回佛像毛利小五郎名声又上升了一个档次，见此机会小兰又试着组建家庭聚会让父母见面，想让父母和好
结果两人又因为吃鱼子酱该不该配面包事情上起了争执，吵了一架，让柯南和小兰一时间不知道该如何是好。
从失败的撮合饭局返回后柯南瞅准大叔不在的时候给远在京都的藤原打了通电话请求能不能再给他点解药，好让他参演园子组建的舞台剧扮演王子和小兰对戏。
这次舞台剧会在校园祭上进行演出到时候很多人都会看，如果自己去不了保不准园子会安排别的男生来扮演王子。
听着柯南的描述藤原一时半会也不知道该如何和他解释解药的最新版本已经进化到能让人维持三个月之久，相信这个数字一定会递增到一年十年甚至永久。
所以他只能让柯南看开点，等解药的有效期到达一年时自然会安排。
调戏完柯南后藤原随即安排橘真夜给柯南送去解药，毕竟黑衣组织里在乎柯南的人大部分都死了剩余的都是藤原的人，所以工藤新一出现大众面前并不会有任何问题。
“是公司打过来的电话吗？”换好睡衣出来的红叶的声音轻飘飘的，似乎在努力掩盖自己的好奇与关切。
藤原放下了手中的手机，转过身，露出一个安抚性的微笑，摇了摇头，表示是朋友的电话，同时伸出手，温和地将红叶拢入怀中。
红叶身体僵了一下，眼神闪烁着复杂的光芒，似乎在藤原的温暖中感受到了不安。她微微侧身，躲过藤原的拥抱，嘴角带着勉强的笑意，推搡着他的胸膛，“我明早还要上学…”
藤原眉头微挑，一副若有所失的表情，但他很快调整了情绪，眼中闪过一丝狡黠一脸无害地笑着，“我保证什么都不干，只是抱着你睡。”
红叶犹豫了片刻，最终在藤原的保证下，轻轻点了点头。她的手伸向了灯开关，轻轻一按，房间顿时陷入了黑暗，很快传来呻吟声，显然是有人食言了.
第二天，当晨光如水般洒满房间，藤原从床上坐起，他的动作轻柔而缓慢，以免惊扰到仍在沉睡的红叶。
他轻手轻脚地穿好衣服后凝视着她安详的睡颜，轻轻地将一缕落在她脸上的头发拨到耳后确定红叶没被惊醒后，准备出门。
在打开卧室门前，藤原忽然停下脚步，转过身来，看着还在睡梦中的红叶，温柔地说道：“忘了跟你说，我想明天出发去一趟米国，大概一个月后回来…”
红叶闻声醒来，睁开了朦胧的睡眼。她缓缓地坐了起来，将被子拉紧，仿佛这样就能抵挡即将来临的孤独。“嗯，去吧…”
藤原轻步走到红叶身边，俯身轻吻了她的额头，手指轻轻地触碰她的手臂，好像在说不出口的告别。
一个月的时间很快就过去了，在米国待了一个月的藤原也开始着手考虑回去的事情。
让他想不到的是来生泪竟然也在掐准时间已经为藤原准备好了他将带走的行李，并带着他来到了机场。
见自己的行李都被准备好了，藤原也没辙只好准备离开，不过走之前藤原望着来生泪连衣裙下被勾勒出来的诱人的酮体，心里有些发痒，想多待一天明天走。
来生泪微微一笑，把行李车推到藤原面前，调皮地挑了挑眉，“我会想你的”
藤原轻轻拉过来生泪的手，凝视着她的眼睛，眼中闪烁着一种淡淡的哀愁和不舍。他的声音低沉而有磁性，“要不买我明天早上的票.”
来生泪的脸颊微微一红，她轻轻地推开了藤原，眼神中闪过一丝坚决。她的手指轻轻摇了摇指头，“不行的，我得说话算数，当初都说好了的…”
藤原叹了口气，嘴角勉强扬起一个微笑，“好吧，那就下个月见…”
“下个月见…”
来生泪重复着同样的话语，声音中带着一种难以掩饰的情感。
她轻轻地站在藤原的面前，两人的目光紧紧锁定，仿佛在这最后的时刻，想要将彼此的面容深深刻印在心底。
最终，他们彼此轻轻地拥抱，然后缓缓分开，转身各自走向不同的方向。
飞机起飞的那一刻，藤原靠在窗边，目光穿过窗户，凝望着云层之上的蔚蓝天空想起了那天做选择的场景：
【一，我喜欢丰满的美少女。完成奖励：系统点数1000000】
【二，我喜欢风情万种的大姐姐。完成奖励:系统点数1000000】
【三，小孩子才做选择，我全都要。完成奖励：系统点数 50000】
（全书完）
(本章完)
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